Liverpool đã gặp phải 3 quả phạt đền gây tranh cãi rõ ràng ở Premier League mùa này. Trong số đó, những quả phạt đền gây tranh cãi với Tottenham và Arsenal chính thức được công nhận là những phán đoán sai lầm.
Tại vòng 7 Ngoại hạng Anh, Liverpool thua Tottenham 1-2. Phút 23, Jones đã giẫm vào mắt cá chân Bissouma trong lúc tranh chấp và bị thẻ đỏ đuổi khỏi sân. Phút 33, Dias ghi một bàn thắng duy nhất nhưng bị phán quyết là không hợp lệ. Quan chức Premier League sau đó thừa nhận đó là một phán đoán sai lầm.
Vòng 18 Ngoại hạng Anh, Liverpool 1-1 Arsenal. Odegaard để bóng chạm tay trong vòng cấm nhưng trọng tài không thổi phạt. Các quan chức Premier League sau đó thừa nhận đó là một phán đoán sai lầm.
Vòng 28 Ngoại hạng Anh, Liverpool 1-1 Manchester City. Doku đá phạt McAllister trong vòng cấm nhưng trọng tài không cho hưởng quả phạt đền.